第 3 章: 決定木による分類と明白な実装¶
3.1 はじめに¶
第 1 章では「20 代ならきのこ派」というルールを人間が書き、第 2 章では欠損値を補完した特徴量を用意しました。この章では、「どの特徴量のどこで区切るか」をデータから自動で探すアルゴリズム、決定木 を自作します。
自作したあとは、JVM の機械学習ライブラリ Tribuo の決定木(CART)に同じデータを学習させ、予測を突き合わせます。Clojure 版は Java 版・Scala 版 と同じ JVM・同じ Tribuo 4.3.2 を使い(ADR 011)、第 2 章で見たとおり同じ乱数で分割したので、Java 版・Scala 版と同じ数値が出るはずです。それを確かめます。
Clojure 版では、次の 3 点に注目してください。
- 木を表す 判別共用体が無い。葉も節もマップにして、鍵があるかどうかで見分ける。Scala 3 の
enum・Rust のenumが与えてくれた網羅性の検査は手に入りません - 同点のときにどちらを選ぶかを、標準の関数に任せると取り違える。
max-keyは同値のとき後ろを返し、frequenciesは順を保たない。いっぽうsort-byは安定 - Java 向けに作られた Tribuo の API(可変なオブジェクト・配列・型引数)を、Clojure の相互運用と型ヒントで呼ぶ
3.2 決定木の仕組み¶
データを 2 つに分けることを繰り返す¶
決定木は、データを「ある特徴量がある値以下か、より大きいか」で 2 つに分けることを繰り返します。分けた先で同じラベルばかりになったら、そこで分けるのをやめて、そのラベルを予測に使います。
どこで分けるかをジニ不純度で決める¶
「よい分け方」とは、分けた後のそれぞれのグループで、ラベルがなるべく 1 種類にそろう分け方です。そろい具合を数値にしたものが ジニ不純度 です。
ジニ不純度 = 1 − Σ(各ラベルの割合)²
| グループのラベル | 割合 | ジニ不純度 |
|---|---|---|
| setosa ×3 | setosa 1.0 | 1 − 1.0² = 0 |
| setosa ×1、virginica ×1 | 0.5、0.5 | 1 − (0.5² + 0.5²) = 0.5 |
| 3 品種 ×1 ずつ | 1/3 ずつ | 1 − 3 × (1/3)² = 2/3 |
ラベルが 1 種類にそろうと 0、混ざるほど大きくなります。分け方の候補ごとに、分けた後の左右のジニ不純度を件数で重み付けして平均し、最も小さくなる分け方を選びます。
3.3 TODO リストの作成¶
TODO リスト:
- ジニ不純度を計算する
- いちばん多いラベルを返す
- 同数なら先に現れたラベルを返す
- 最良の分割を探す
- ラベルを完全に分けられる境界を見つける
- 複数の特徴量から最良の特徴量と境界を選ぶ
- ラベルが 1 種類なら分割しない
- 決定木を学習して予測する
- 木の深さを制限する
- 学習した木を読める形で表示する
- Tribuo の決定木と突き合わせる
- 実データで深さと正解率の関係を表示する
3.4 ジニ不純度を計算する¶
仮実装から始める¶
ラベルが 1 種類ならジニ不純度は 0 です。
(deftest ジニ不純度
(testing "一種類だけならジニ不純度は零になる"
(is (< (abs (ch/gini ["setosa" "setosa"])) 1e-12))))
ch/gini がまだ無いので落ちます(Red)。Clojure は動的型付けですが、未定義の var はコンパイル時に見つかります。 第 1 章で見たとおり、名前の解決だけは静的なので、Red の見え方は Unable to resolve symbol です。
仮実装で 0.0 を返して Green にします。
三角測量¶
2 種類が半分ずつ、3 品種が 1 件ずつの場合を足します。
(testing "二種類が半々ならジニ不純度は零点五になる"
(is (< (abs (- (ch/gini ["setosa" "virginica"]) 0.5)) 1e-12)))
(testing "三種類が均等ならジニ不純度は三分の二になる"
(is (< (abs (- (ch/gini ["setosa" "versicolor" "virginica"]) (/ 2.0 3))) 1e-12)))
3 つめの期待値に (/ 2.0 3) と書いているところが Clojure 特有です。(/ 2 3) と書くと有理数 2/3 になります。 Clojure は分数を正確に持てる言語なので、整数どうしの割り算は約分された有理数を返します。ここでは浮動小数点数と比べたいので、片方を 2.0 にして小数の割り算にしています。
== ではなく許容誤差付きで比べているのは、2/3 が浮動小数点で正確に表せないからです。第 1 章の正解率、第 2 章の平均値と同じ扱いです。
Green: 明白な実装¶
(defn gini
"ジニ不純度。ラベルが 1 種類なら 0 で、種類が多く均等なほど大きい。"
[labels]
(if (empty? labels)
0.0
(- 1.0 (reduce + (map (fn [[_ n]] (let [share (/ (double n) (count labels))] (* share share)))
(frequencies labels))))))
frequencies が、ラベルごとの件数を数えます。 (frequencies ["a" "b" "a"]) が {"a" 2 "b" 1} になる標準の関数で、Scala 版が foldLeft と ListMap で 6 行かけて書いたところが 1 語です。
(fn [[_ n]] ...) の引数に注目してください。マップを map でたどると [鍵 値] のベクタが順に渡るので、引数の位置で分配束縛して値だけを取り出しています。_ は「使わない」の印です。
空のラベルで 0.0 を返す枝は、後で best-split から空のグループが渡りうるので置いています。(/ (double n) 0) が NaN になるのを避けるためで、テストでは直接確かめていません(分割の候補を作る過程で空にならないため)。
(double n) で明示的に小数にしています。これを忘れると (/ 2 3) が有理数になり、(* share share) が 4/9 になって、最終的に 1 - 4/9 = 5/9 という有理数が返ります。値としては正しいのに型が違うので、== では通り = では落ちる、という分かりにくい失敗をします。Clojure で数値を扱うときの定番の注意点です。
3.5 いちばん多いラベルを返す¶
葉に置くラベルは、そこに残ったデータの多数決で決めます。
(deftest いちばん多いラベル
(testing "いちばん多いラベルを返す"
(is (= "virginica" (ch/majority ["setosa" "virginica" "virginica"]))))
(testing "同数なら先に現れたラベルを返す"
(is (= "virginica" (ch/majority ["virginica" "setosa"])))))
2 つめが肝心です。同数のときにどちらを選ぶかは、決めておかないと結果が揺れます。 Java 版・Scala 版は「先に現れたほう」と決めたので、そろえます。
max-key は同値のとき後ろを返す¶
最初は max-key で書けると思いました。(max-key f x y ...) は f の値が最大になる引数を返す関数です。しかし、同値のときにどちらを返すかを確かめると、こうなります。
(println "max-key =" (max-key {"setosa" 1 "virginica" 1} "setosa" "virginica"))
(println "max-key 逆 =" (max-key {"setosa" 1 "virginica" 1} "virginica" "setosa"))
max-key = virginica
max-key 逆 = setosa
どちらの場合も、後ろの引数が返ります。 max-key は > ではなく < で畳む(「今までの最大より小さくなければ更新する」)ので、同値でも更新されるためです。min-key は逆に前を返します。これは「最初の最大値を返す」ことを期待していると必ず取り違えるところで、Scala 版の maxBy(最初を返す)と振る舞いが違います。
frequencies は順を保たない¶
もう 1 つ、frequencies の戻り値をそのままたどるのも危険です。
(println "frequencies の順 =" (pr-str (keys (frequencies ["virginica" "setosa" "virginica"]))))
frequencies の順 = ("virginica" "setosa")
この例では挿入順に見えますが、保証されていません。frequencies は transient の空マップから作るので、鍵が 8 個までは配列マップ(挿入順)、超えるとハッシュマップ(並びは不定)になります。アヤメの品種は 3 つなので偶然たまたま挿入順ですが、そこに頼った実装は、ラベルの種類が増えた瞬間に壊れます。第 2 章の最後で触れた「マップの鍵の並びに頼らない」がここでも効きます。
Green: 2 つの落とし穴を避けて書く¶
(defn majority
"いちばん多いラベルを返す。同数なら先に現れたほうを選ぶ。
frequencies は順を保たないので、最初に現れた順(distinct)でたどり、厳密な不等号で比べる。"
[labels]
(let [counts (frequencies labels)]
(reduce (fn [best label] (if (> (counts label) (counts best)) label best))
(distinct labels))))
2 つの落とし穴に、2 つの手当てが対応しています。
- たどる順は
(distinct labels)— 元の並びのまま重複を落とすので、「先に現れた順」がそのまま得られます。frequenciesは件数を引く辞書としてだけ使います - 比較は厳密な
>— 同数ならbestを更新しないので、先に現れたほうが残ります。max-keyを使っていたら後ろが残っていました
(counts label) と、マップを関数として呼んでいます。Clojure のマップは自分自身が関数で、鍵を渡すと値が返ります。キーワードが関数であること(第 1 章)と対になる性質で、(get counts label) より短く書けます。
docstring に理由を 2 行書いたのは、この関数が「なぜこう書いてあるか」だけでできているからです。素直に書けば (key (apply max-key val counts)) の 1 行で済むのに、そうしていない理由がコードからは読めません。
3.6 最良の分割を探す¶
分割をマップで表す¶
分割は「どの列の、どの値で区切るか、そのときの不純度はいくつか」の 3 つ組です。
{:feature :花弁幅 :threshold 0.75 :impurity 0.0}
Scala 版は case class Split(feature, threshold, impurity) を宣言しました。Clojure 版はここもマップです。
テスト¶
(defn- column [value] {:花弁幅 value})
(def ^:private three-species
[(mapv column [0.2 0.3 1.2 1.4 2.0 2.2])
["setosa" "setosa" "versicolor" "versicolor" "virginica" "virginica"]])
(deftest 分割の選び方
(testing "分けられないときは分割を返さない"
(is (nil? (ch/best-split [(column 0.2) (column 0.3)] ["setosa" "setosa"] [:花弁幅]))))
(testing "不純度がいちばん小さくなる分割を選ぶ"
(let [[x t] three-species
split (ch/best-split x t [:花弁幅])]
(is (= :花弁幅 (:feature split)))
(is (< (abs (- (:threshold split) 0.75)) 1e-12)))))
three-species は、花弁幅だけを持つ 6 件のフィクスチャです。0.2・0.3 が setosa、1.2・1.4 が versicolor、2.0・2.2 が virginica なので、0.3 と 1.2 の中点 0.75 で切れば setosa が完全に分かれます。
フィクスチャがただのベクタなので、def でトップレベルに置けます。 型を宣言していないぶん、テストの準備がこれだけ短くなります。column という 1 行のヘルパーを足しただけで、6 件のデータが (mapv column [0.2 0.3 ...]) で作れます。
「分けられないときは nil」もここで決めています。Scala 版は Option[Split] の None、Rust 版は Option。Clojure は第 2 章と同じく nil です。
期待値は 0.75 だが、実装は 0.7500...¶
(:threshold split) を 0.75 と厳密に比べず、許容誤差にしているのは慎重さのためです。(0.3 + 1.2) / 2.0 は 2 進数で正確に表せる値なので実際には = 0.75 でも通りますが、境界の値が正確に表せるかどうかはデータ次第なので、最初から誤差込みで書いています。実データの境界(0.2950)は正確に表せません。
Green: 候補を列挙して選ぶ¶
分割の探索は、2 つの関数に分けました。
(defn- weighted-gini
"左右の不純度の重み付き平均。"
[left right]
(/ (+ (* (count left) (gini left)) (* (count right) (gini right)))
(+ (count left) (count right))))
(defn- candidates
"1 つの列で、隣り合う値の中点を境界にした分割の候補をすべて返す。
sort-by は安定なので、同じ値の並びは元の順のまま。"
[x t feature]
(let [sorted (sort-by first (map (fn [features label] [(get features feature) label]) x t))
values (mapv first sorted)
labels (mapv second sorted)]
(keep (fn [i]
(when-not (== (values (dec i)) (values i))
{:feature feature
:threshold (/ (+ (values (dec i)) (values i)) 2.0)
:impurity (weighted-gini (subvec labels 0 i) (subvec labels i))}))
(range 1 (count sorted)))))
candidates に、第 2 章までの道具が集まっています。
(map (fn [features label] ...) x t)— 第 2 章の(mapv vector x t)と同じく、2 つのコレクションを同時にたどりますsort-by first— 値で並べ替えます。sort-byは安定(同じ値の要素の相対順が変わらない)なので、同じ値の行の並びは元のままです。これは仕様として保証されていて、majorityの「先に現れたほう」と合わせて、同点のときの振る舞いが決まりますkeep+when-not— 第 2 章のcolumn-meansと同じ形です。隣り合う値が同じなら境界を作れないので、when-notがnilを返し、keepがそれを落とします。「候補を作りつつ、作れないものは飛ばす」が 1 つの式になりますsubvec— ベクタの一部を、中身を写さずに見る関数です。(subvec labels 0 i)は元のベクタを参照するだけなので、候補ごとに配列を作り直しません。valuesとlabelsをmapvでベクタにしておいたのは、subvecと添字アクセス((values i))を使うためです
(values i) と、ベクタを関数として呼んでいます。マップと同じくベクタも関数で、添字を渡すと要素が返ります。
(defn best-split
"左右の不純度の重み付き平均が最も小さくなる分割を返す。分けられなければ nil。
同じ不純度なら先に見つけた(列の順で前の)分割を選ぶ。"
[x t columns]
(when-not (or (empty? x) (zero? (gini t)))
(let [all (mapcat #(candidates x t %) columns)]
(when (seq all)
(reduce (fn [best candidate]
(if (< (:impurity candidate) (:impurity best)) candidate best))
all)))))
mapcat が、列ごとの候補を 1 本につなぎます。columns の順にたどるので、先に来るのは列の順で前の特徴量の候補です。そして reduce の比較は厳密な < なので、同じ不純度なら先に見つけたものが残ります。majority とまったく同じ手当てで、理由も同じです。
when-not と when が二重になっているのは、「分けられない」の理由が 2 通りあるからです。データが空か、ラベルが 1 種類か((zero? (gini t)))。どちらも nil を返し、呼ぶ側は nil か分割かだけを見ます。
3.7 決定木を学習して予測する¶
木をどう表すか¶
ここが Clojure でいちばん悩むところです。決定木は「葉か、節か」のどちらかで、ほかの形は無い——という構造を、Clojure では表せません。
| 言語 | 木の表し方 | 網羅性の検査 |
|---|---|---|
| Scala 3 | enum Tree: case Leaf(...); case Node(...) |
match をコンパイラが検査(-Xfatal-warnings で強制) |
| Rust | enum Tree { Leaf(...), Node(...) } |
match をコンパイラが検査(必須) |
| Java | sealed interface + 2 つの record | switch 式をコンパイラが検査 |
| Clojure | マップ 2 種({:label ...} と {:split ... :left ... :right ...}) |
無い |
選んだ形はこうです。
;; 木は葉か節のどちらかで、どちらもマップで表す。
;; 葉は {:label "setosa"}、節は {:split ... :left ... :right ...}。
;; Clojure には判別共用体が無いので、鍵があるかどうかで見分ける(網羅性は検査されない)。
(defn leaf? "葉かどうかを返す。" [tree] (contains? tree :label))
(defn node? "節かどうかを返す。" [tree] (contains? tree :split))
:label があれば葉、:split があれば節という取り決めです。defrecord でレコード型を 2 つ作って satisfies? で見分ける手もありますが、その場合も「2 つしか無い」ことは検査されないので、得るものは型名だけです。素のマップのままにして、見分ける述語に名前を付けるほうを選びました。
失うものははっきりしています。
- 場合分けを書き忘れても、コンパイラは何も言いません。 Scala 版は
caseを 1 つ消すとmatch may not be exhaustiveが出ます。Clojure では(if (leaf? tree) ... ...)のelseが正しいかどうか、人が保証します - 第 3 の形が混ざっても気づけません。
{:label "x" :split ...}のようなマップを作ってしまっても、leaf?が先に真になるだけです
得るものもあります。木がただのデータなので、= でそのまま比べられ、println でそのまま読め、assoc で一部を差し替えられます。 後で出てくる format-tree のテストが、木を組み立て直さずに書けているのはそのおかげです。
学習¶
(defn fit
"深さの上限まで分割を繰り返して木を作る。max-depth が nil なら上限なし。"
[x t columns max-depth]
(let [split (when-not (and max-depth (zero? max-depth)) (best-split x t columns))]
(if (nil? split)
{:label (majority t)}
(let [pairs (map vector x t)
[left right] [(filter #(goes-left? split (first %)) pairs)
(remove #(goes-left? split (first %)) pairs)]
next-depth (when max-depth (dec max-depth))]
{:split split
:left (fit (mapv first left) (mapv second left) columns next-depth)
:right (fit (mapv first right) (mapv second right) columns next-depth)}))))
「分割が見つからなければ葉」が、すべての終了条件をまとめています。 ラベルが 1 種類でも、深さの上限に達しても、分けられる境界が無くても、split は nil になります。best-split が 3 つの場合をすべて nil に写しているので、fit 側の場合分けは 1 つで済みました。
深さの上限は nil(上限なし)か数値で表します。(when-not (and max-depth (zero? max-depth)) ...) は「上限があり、それが 0 なら分割しない」。(when max-depth (dec max-depth)) は「上限があれば 1 減らす、なければ nil のまま」。nil を「無い」として扱う関数が並んでいるので、Option の map に当たる処理が when で書けています。
filter と remove を 2 回に分けているのは読みやすさのためです。(group-by ...) や split-with でも書けますが、「左へ行くもの」「行かないもの」がそのまま 2 行に並ぶほうが、アルゴリズムとの対応が見えます。
予測¶
(defn predict-one
"木をたどって 1 件のラベルを予測する。"
[tree features]
(if (leaf? tree)
(:label tree)
(recur (if (goes-left? (:split tree) features) (:left tree) (:right tree)) features)))
recur が末尾呼び出しです。 JVM には末尾呼び出しの最適化が無いので、Clojure は recur という専用の形を用意して「ここは自分を呼び直すだけ」と明示させます。(predict-one ... ...) と書いても動きますが、木が深いとスタックが尽きます。
recur には検査が付いていて、末尾でない位置に書くとコンパイルエラーになります。「再帰のつもりが末尾でなかった」という誤りだけは、静的に防げます。
fit のほうは recur にできません。左右の 2 回呼ぶので、片方は末尾になりようがないからです。木の深さはデータの件数までなので、実用上は問題になりません。
(deftest 決定木の学習と予測
(testing "深さを制限しなければ訓練データを全部当てる"
(let [[x t] three-species]
(is (= t (ch/predict (ch/fit x t [:花弁幅] nil) x)))))
(testing "深さ一なら二つの葉になる"
(let [[x t] three-species
tree (ch/fit x t [:花弁幅] 1)]
(is (ch/node? tree))
(is (ch/leaf? (:left tree)))
(is (ch/leaf? (:right tree))))))
2 つめのテストが、木がただのデータであることの見返りです。(:left tree) で部分木をそのまま取り出して、leaf? を当てられます。アクセサも訪問者パターンも要りません。
3.8 学習した木を表示する¶
(defn format-tree
"木を字下げ付きの文字列にする。"
([tree] (format-tree tree ""))
([tree indent]
(if (leaf? tree)
(str indent (:label tree) "\n")
(let [{:keys [feature threshold]} (:split tree)
border (format "%.4f" threshold)]
(str indent (name feature) " <= " border "\n" (format-tree (:left tree) (str indent " "))
indent (name feature) " > " border "\n" (format-tree (:right tree) (str indent " ")))))))
第 1 章の dataset/dir と同じ多アリティで、字下げの初期値を与えています。既定引数の無い言語で既定引数を書く、Clojure の定型です。
(testing "木を字下げ付きの文字列にする"
(let [[x t] three-species]
(is (= "花弁幅 <= 0.7500\n setosa\n花弁幅 > 0.7500\n versicolor\n"
(ch/format-tree (ch/fit x t [:花弁幅] 1))))))
期待値を 1 つの文字列リテラルで書いています。 表示は「読める形にする」ことが目的なので、行に分けて組み立てるより、出てくるものをそのまま書いたほうが変化に気づけます。
(format "%.4f" threshold) は String/format の包みです。ロケールを渡していないので既定のロケールが使われますが、%.4f の小数点はどのロケールでも . になる——とは限りません(ドイツ語圏なら ,)。Java 版・Scala 版は Locale.ROOT を明示しています。Clojure 版は clojure.core/format が String/format をロケールなしで呼ぶため、環境によっては出力が変わりえます。テストが固定しているので気づけますが、移植性を重んじるなら (String/format java.util.Locale/ROOT "%.4f" ...) と書くべきところです。
3.9 Tribuo の決定木と突き合わせる¶
なぜ Tribuo なのか¶
Clojure の機械学習ライブラリには scicloj.ml・tech.ml.dataset といった選択肢があります。当初は Java 版の初期と同じく Smile を第一候補にしていましたが、調べたところ Smile 3.1.1 のライセンスが GPL-3.0 でした。本シリーズのリポジトリは公開なので、GPL の伝播を考えずに依存に入れるわけにはいきません。
そこで、Java 版・Kotlin 版・Scala 版がすでに使っている Tribuo 4.3.2(Apache-2.0、Oracle Labs)に合わせました。この判断は ADR 011 に記録しています。結果として、同じ JVM・同じライブラリ・同じ乱数という 3 つがそろい、Java 版・Scala 版との突き合わせが意味を持つ形になりました。「ライセンスの制約から入った選択が、比較可能性という別の価値を生んだ」ことになります。
Tribuo のデータセットに変換する¶
(def ^:private label-factory
"Tribuo のラベルの作り方。"
(LabelFactory.))
(def ^:private min-child-weight
"子の節に必要な事例の重みの最小値。1 にすると、自作の木と同じく 1 件になるまで分けられる。"
1.0)
(defn- to-example
"特徴量とラベルを Tribuo の事例にする。列名は文字列の配列で渡す。"
^Example [features columns ^Label label]
(ArrayExample. label
^"[Ljava.lang.String;" (into-array String (map name columns))
(double-array (map #(get features %) columns))))
短い関数ですが、Clojure から Java を呼ぶときの要点が詰まっています。
^Exampleが戻り値の型ヒント、^Labelが引数の型ヒントです。Clojure は型を宣言しませんが、曖昧なオーバーロードを選び分けるためのヒントは書けます。ArrayExampleには引数の数と型が同じくらい似た多重定義が並んでいるので、ヒントが無いと実行時にリフレクションで解決され、遅いうえに選択を誤りえます^"[Ljava.lang.String;"が、いちばん見慣れない書き方でしょう。Stringの配列を表す JVM 内部の型名です。^String[]のような書き方が Clojure には無いので、JVM の記法をそのまま文字列で書きます。[Lが「参照型の配列」、続くのがクラス名、末尾のセミコロンまでが 1 つの型名です(into-array String ...)・(double-array ...)で、Clojure のシーケンスを Java の配列にします。Scala 版のtoArrayに当たります。毎回新しい配列を作るので、Tribuo に渡した後に書き換えられても手元のマップは無事です(map name columns)— 列名はキーワード(:がく片幅)なので、Tribuo に渡す前に文字列に直します。第 2 章で列名をキーワードにした代金を、ここで払っています
(defn- to-dataset
"特徴量と正解ラベルを Tribuo のデータセットにする。"
[x t columns]
(let [examples (mapv (fn [features label] (to-example features columns (Label. label))) x t)
provenance (SimpleDataSourceProvenance. "features" label-factory)]
(MutableDataset. (ListDataSource. examples label-factory ^Provenance provenance))))
ListDataSource は Java の List を受け取りますが、Clojure のベクタは java.util.List を実装しているので、変換は要りません。Scala 版が asJava を書いたところが不要です。Clojure のコレクションが Java のインターフェースを満たすように作られていることの、分かりやすい見返りです。
^Provenance のヒントは、ListDataSource のコンストラクタが DataSourceProvenance と Provenance の両方を取る形を持つために必要でした。ここも「どの多重定義を呼ぶか」の問題です。
SimpleDataSourceProvenance が要るのは、Tribuo が モデルにデータの出どころを記録する設計だからです。どのデータをどの設定で学習したかがモデル自身に残ります。Java 版・Scala 版と同じ扱いです。
学習と予測¶
(defn tribuo-predict
"Tribuo の CART(ジニ不純度)で学習して予測する。深さは max-depth(nil なら上限なし)。"
[x-train t-train x-test columns max-depth]
(let [trainer (CARTClassificationTrainer. (int (or max-depth Integer/MAX_VALUE))
(float min-child-weight) (float 0.0) (float 1.0)
(GiniIndex.) 0)
model (.train trainer (to-dataset x-train t-train columns))]
(mapv (fn [features]
(.getLabel (.getOutput (.predict model (to-example features columns LabelFactory/UNKNOWN_LABEL)))))
x-test)))
(or max-depth Integer/MAX_VALUE) が、2 つの「上限なし」の約束をつなぎます。自作の木は nil、Tribuo は Integer/MAX_VALUE。or が短絡するので 1 つの式で済みました(第 2 章の get の話とは違い、or はマクロなので安全です)。
(int ...)・(float ...) の変換は必須です。Clojure の数値は既定で long/double なので、int/float を取るコンストラクタには明示的に落とす必要があります。忘れると ClassCastException か、リフレクションでの解決失敗になります。「数値の型を書かなくていい」言語が、Java の API の前では書かされる場面です。
CARTClassificationTrainer の引数は Java 版・Scala 版と同じです。
| 引数 | 渡した値 | 意味 |
|---|---|---|
| maxDepth | 呼び出し側で指定 | 木の深さの上限。制限なしは Integer/MAX_VALUE |
| minChildWeight | 1.0 |
件数(重み)がこの値に満たない節は分割しない |
| minImpurityDecrease | 0.0 |
分割に必要な不純度の減少量の下限 |
| fractionFeaturesInSplit | 1.0 |
分割ごとに調べる特徴量の割合。1.0 ですべて調べる |
| impurity | (GiniIndex.) |
ジニ不純度で分割を選ぶ |
| seed | 0 |
乱数のシード |
minChildWeight の既定値は 5 で、件数が 5 未満の節は分割しません。自作の決定木は 1 件になるまで分け切るので、突き合わせでは 1.0 にして条件をそろえます。ここをそろえないと、深いところで木の形が変わります。
予測のときは、ラベルの分からない事例に LabelFactory/UNKNOWN_LABEL を渡します。Tribuo の事例は必ずラベルを持つ設計なので、「まだ分からない」を表す特別なラベルが用意されています。
同点のときの選び方¶
Kotlin 版では、iris で予測を比べたところ深さ 3 以上で 1 件だけ一致せず、その原因が 2 つの「同点」の扱いの違いだと突き止めました(ADR 002)。
- 葉の多数決が同数のとき: 自作の
majorityは先に現れたラベルを返すので、ラベルの並び順で予測が変わります。Tribuo は並び順に依存しません - 同じ不純度の分割候補が複数あるとき: 自作の
best-splitは列の順で先の特徴量を選び、Tribuo は特徴量名の順で先のものを選びます
どちらも「どちらを選んでも不純度は同じ」場面での選び方の違いで、どちらかが間違っているわけではありません。Clojure から呼んでも同じ Tribuo なので、この振る舞いは変わりません。Clojure 版では、この 2 つの学習用テストを持たず、Java 版・Kotlin 版で確かめた結果を引き継いでいます。
ただし、3.5 節で見たとおり Clojure では「先に現れたほう」を保つこと自体に手当てが要りました。max-key に任せていたら後ろが選ばれ、frequencies の順にたどっていたら不定になります。同点の扱いをそろえる前に、同点の扱いを決めきる必要があった、ということです。
実データで突き合わせる¶
(deftest 自作とTribuoの予測はどの深さでも一致する
;; java.util.Random と同じ手順で分けているので、Java 版・Scala 版とも同じ結果になる
(when-let [split (iris-split)]
(doseq [max-depth [1 2 3 4 5 nil]]
(let [ours (ch/predict (ch/fit (:x-train split) (:t-train split) (columns split) max-depth)
(:x-test split))
theirs (ch/tribuo-predict (:x-train split) (:t-train split) (:x-test split)
(columns split) max-depth)]
(is (= ours theirs) (str "深さ " max-depth))))))
深さ 1〜5 と制限なしのどれでも、テストデータ 45 件の予測が Tribuo と全件一致しました。Java 版・Scala 版と同じ結果です。
clojure.test にはパラメータ化テストの仕組みが無いので、doseq で回しています。is の 2 つ目の引数に深さを渡しているので、失敗したときにどの深さかが分かります。Scala 版が foreach で回したのと同じやり方です。
Kotlin 版は深さ 3 以上で 1 件ずつ一致しませんでしたが、これは Tribuo の振る舞いが変わったからではありません。第 2 章で見たとおり、Clojure 版は Java 版・Scala 版と同じ java.util.Random で分けるので、訓練データとテストデータに入る行が Kotlin 版と違います。この分割では、テストデータの予測が「多数決が同数の葉」や「同じ不純度の分割候補の違いで進む先が変わる行」に当たらなかった、ということです。
正解率と木の形も固定しました。
(deftest 深さ二の決定木はテストデータの四十五件中四十三件を正しく分類する
(when-let [split (iris-split)]
(let [tree (ch/fit (:x-train split) (:t-train split) (columns split) 2)
predictions (ch/predict tree (:x-test split))]
(is (< (abs (- (chapter01/accuracy predictions (:t-test split)) (/ 43.0 45))) 1e-12)))))
(deftest 深さ二の決定木は花弁幅で三種類に分かれる
(when-let [split (iris-split)]
(is (= (str "花弁幅 <= 0.2950\n Iris-setosa\n"
"花弁幅 > 0.2950\n 花弁幅 <= 0.6500\n Iris-versicolor\n"
" 花弁幅 > 0.6500\n Iris-virginica\n")
(ch/format-tree (ch/fit (:x-train split) (:t-train split) (columns split) 2))))))
正解率の計算に、第 1 章の chapter01/accuracy をそのまま使っています。第 1 章はきのこ派・たけのこ派、この章はアヤメの品種ですが、「予測と正解のベクタを受け取って一致率を返す」という形は同じなので、型を宣言していないぶん、そのまま再利用できます。
columns は分割の結果から取り出しています。
(defn- columns [split] (vec (keys (first (:x-train split)))))
第 2 章の最後で触れた「マップの鍵の並びは 8 個までなら挿入順」に、ここで頼っています。特徴量は 4 列なので配列マップになり、fill-missing が columns の順に組み立てた並びがそのまま出ます。 ただし列が 9 つ以上になれば崩れるので、堅くするなら :columns を分割の結果にも持ち回すべきところです。この章では列が 4 つに固定されているので、そのままにしました。「今は動くが、条件が変わると崩れる」ことを自覚して残している箇所です。
3.10 実データで深さと正解率を表示する¶
(def ^:private max-depths
"正解率を比べる深さ。nil は制限なし。"
[1 2 3 4 5 nil])
(defn- score
"正解率を小数 4 桁の文字列にする。"
[predictions labels]
(format "%.4f" (chapter01/accuracy predictions labels)))
(defn- accuracy-row
"自作と Tribuo で学習し、正解率を 1 行にする。"
[max-depth split columns]
(let [tree (fit (:x-train split) (:t-train split) columns max-depth)
tribuo (tribuo-predict (:x-train split) (:t-train split) (:x-test split) columns max-depth)]
(str/join "\t" [(or max-depth "制限なし")
(score (predict tree (:x-train split)) (:t-train split))
(score (predict tree (:x-test split)) (:t-test split))
(score tribuo (:t-test split))])))
(defn run
"深さごとの正解率と、深さ 2 の決定木を表示する。"
[]
(let [split (chapter02/prepare-iris (str (dataset/dir) "/iris.csv") 0.3 0)
columns (vec (keys (first (:x-train split))))]
(println "深さ\t訓練データ\tテストデータ\tTribuo")
(doseq [max-depth max-depths]
(println (accuracy-row max-depth split columns)))
(println)
(println "深さ 2 の決定木:")
(print (format-tree (fit (:x-train split) (:t-train split) columns 2)))))
(or max-depth "制限なし") がここでも効いています。深さの並び [1 2 3 4 5 nil] に「制限なし」を混ぜたまま、表示のときだけ文字列に差し替えられます。Scala 版は MaxDepths のループと「制限なし」の行を別に書いていました。nil が値として自由に混ざる言語ならではの短さです。
(str/join "\t" [...]) で 4 つの欄を並べます。Tribuo の正解率まで同じ表に出しているのは、自作と一致していることが実行しただけで見えるようにするためです。
実行します。
$ clojure -M:run chapter03
深さ 訓練データ テストデータ Tribuo
1 0.6762 0.6444 0.6444
2 0.9333 0.9556 0.9556
3 0.9524 0.9556 0.9556
4 0.9619 0.9556 0.9556
5 0.9810 0.9333 0.9333
制限なし 1.0000 0.9333 0.9333
深さ 2 の決定木:
花弁幅 <= 0.2950
Iris-setosa
花弁幅 > 0.2950
花弁幅 <= 0.6500
Iris-versicolor
花弁幅 > 0.6500
Iris-virginica
3 列目と 4 列目が、どの深さでも同じ値です。 自作の決定木と Tribuo の CART が、テストデータ 45 件について同じ予測を返しています。
そして この表は Java 版・Scala 版とまったく同じ数値です。第 2 章で乱数と手順をそろえた効果が、章をまたいで確かめられました。
表そのものも読みどころです。
- 深さ 1 では 0.6444 — 1 回しか分けられないので、3 品種を 2 つにしか分けられません
- 深さ 2 で 0.9556 — 花弁幅だけを 2 回使って、3 品種をほぼ分け切っています
- 訓練データの正解率は深さとともに上がり続け、制限なしで 1.0000 — 訓練データを完全に覚えました
- テストデータの正解率は深さ 5 から下がる(0.9556 → 0.9333) — これが 過学習 です。訓練データに合わせすぎて、見ていないデータに弱くなりました
「訓練データで 100% 当たる」ことが良いことではない、というのがこの表の教えです。第 1 章で「学習に使ったデータで性能を測ってはいけない」と書いた理由が、数字として出ています。
木の中身も読めます。花弁幅だけで 3 品種がほぼ分かれています。 0.2950 以下なら Iris-setosa、0.6500 より大きければ Iris-virginica。これは第 2 章の散布図で人が見つけられる傾向と同じで、決定木はそれを自動で見つけたことになります。境界の値(0.2950・0.6500)が第 2 章で標準化していない生の値に見えないのは、iris.csv の値が 0〜1 に収まる形で配布されているためです。
3.11 可視化について¶
Clojure 版には Notebook の節を設けません。深さと正解率の折れ線グラフや、Tribuo の getTopFeatures(特徴量が分割に使われた回数)は Kotlin 版の第 3 章 の「Notebook で探索する」の節を、scikit-learn による木の図は Python 版の第 3 章 を参照してください。Clojure 版で深さと正解率の関係を見るには、3.10 節の表と format-tree の出力が同じ役割を果たします。
3.12 まとめ¶
この章では、決定木を自作し、Tribuo の決定木と予測を突き合わせました。Clojure に固有の論点は次のとおりです。
- 判別共用体が無いので、木もマップ — 葉は
{:label ...}、節は{:split ... :left ... :right ...}。leaf?/node?で見分ける。網羅性は検査されないので、場合分けの漏れは人が保証する。見返りは、木がただのデータなので=で比べられ、部分木をそのまま取り出せること - 同点のときの選び方を、標準の関数に任せない —
max-keyは同値のとき後ろを返す(<で畳むため)。frequenciesは鍵が 8 個を超えると順を保たない。distinctの順でたどり、厳密な>で畳むことで「先に現れたほう」を守った。いっぽうsort-byは安定なので、そこは任せられる - 数値の型を自分で落とす —
(double n)を忘れると有理数になり、(int ...)・(float ...)を忘れると Java の API に渡らない。型を書かない言語が、Java の前では書かされる - 型ヒントで多重定義を選ぶ —
^Example・^Label・^Provenance、そして^"[Ljava.lang.String;"。型宣言ではなく「どのメソッドを呼ぶか」を決めるための注釈として要る - Clojure のベクタはそのまま
java.util.List— Scala 版がasJavaを書いたところが不要。いっぽう配列はinto-array・double-arrayで作る nilが値として混ざれる — 深さの上限なしをnilで表し、[1 2 3 4 5 nil]と並べたまま(or max-depth "制限なし")で表示だけ差し替えた。recurで末尾再帰を明示する必要があることと合わせて、Clojure の書き味が出た部分- Java 版・Scala 版と完全に一致した — 深さごとの正解率も、深さ 2 の木の境界(0.2950・0.6500)も、Tribuo との全件一致も同じ。GPL の Smile を避けて Tribuo を選んだ判断(ADR 011)が、比較可能性という別の価値を生んだ
TODO リスト(この章の完了時点):
- ジニ不純度を計算する
- いちばん多いラベルを返す
- 最良の分割を探す
- 決定木を学習して予測する
- 木の深さを制限する
- 学習した木を読める形で表示する
- Tribuo の決定木と突き合わせる
- 実データで深さと正解率の関係を表示する
深さ 2 の決定木の正解率は 45 件中 43 件(0.9556)で、テストデータの正解率は深さ 5 から下がり始めました。次の章では、ここまでのコードとデータをどう管理するか(バージョン管理とデータ管理)を扱います。